У 10–20% жінок діагностується рецидивуючий цистит (це жінки без факторів ризику розвитку ускладненої інфекції сечовивідних шляхів). Його етіологія збігається з неускладненим циститом. Реінфекція значно частіше розвивається, ніж рецидив. У деяких жінок є явний зв’язок між статевими контактами та наступними епізодами інфекції сечовивідних шляхів. Урологічне обстеження не потрібне у всіх жінок з циститом за наявності симптомів або безсимптомним рецидивуючим циститом, оскільки його результати не впливають на лікування. Бактеріологічне дослідження сечі виявляє типові мікроорганізми неускладненої інфекції сечостатевих шляхів (E. coli, S. saprophyticus). Наявність Proteus sрp. може вказувати на ускладнену інфекцію сечовивідних шляхів. Чоловіки з рецидивною інфекцією сечовивідних шляхів повинні бути обстежені щодо простатиту, уретриту та неповного випорожнення сечового міхура.
Якщо інфекція сечовивідних шляхів рецидивує після 6 міс профілактичного лікування, профілактику можна продовжити на 2–3 роки.